Small RNA是一大类调控分子,几乎存在于所有的生物体中。Small RNA包括:miRNA、ncRNA、siRNA、snoRNA、piRNA、rasiRNA等。Small RNA有多种多样的作用途径,包括mRNA降解、翻译抑制、异染色质形成以及DNA去除,来调控生物体的生长发育和疾病发生,在基因表达调控、动植物个体发育、疾病的发生等生理过程中起着重要的作用。Small RNA测序正是对这一类重要的调控小RNA—特别是microRNA(miRNA)展开分析,利用高通量测序平台,对样本中富集到的18-32 nt的小RNA片段进行测序,对获得的有效数据进行序列长度分布统计,将筛选后的高质量序列分类注释,获得样品中包含的各组分及表达量信息,实现small RNA序列的鉴定、靶基因分析和功能注释等多项分析。
PS:
目标物种有无参考基因组,都能进行分析,无参可选择近缘物种
如何确定目标物种的近源物种是否在miRBase收录?
登录NCBI-taxonomy(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy)查找目标物种所属分类,在miRBase物种列表的分类一列进行查找。
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