长链非编码RNA（lncRNA）是一类长度大于200 nt 的非编码RNA（ncRNA），广泛存在于各种生物体内，在表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用，与动植物的生长发育，人类的疾病发生有着密切关系，也可作为疾病诊断的标志物或是重要靶点。
lncRNA测序是通过高通量测序技术及生物信息学方法在整体水平上解释样品中lncRNA及mRNA全面信息的研究方法。IncRNA可通过cis/trans作用方式直接调控靶基因转录，也可作为分子海绵吸附miRNA，抑制其与mRNA的结合，从而达到调控转录。目前IncRNA在调控mRNA、参与动植物生物学过程与信号通路等方面，都发挥重要作用。