焦磷酸测序是一种使用单链DNA模板一次合成互补链一个碱基，并在每一步通过监测化学发光信号来检测合成的碱基(A、T、G、C)的新型酶联级化学发光测序技术。
可应用于多领域的单核苷酸多态性(SNP)、插入/缺失(indels)、短串联重复序列、人类白细胞抗原(HLA)分型、基因拷贝数、RNA等位基因失衡、甲基化分析等，尤其适用于已知DNA短序列（20-50bp）进行快速测序。