lTMT标记定量蛋白质组学:TMT™(Tandem Mass Tag™)技术是由美国Thermo Scientific公司研发的一种多肽体外标记技术。该技术采用10种同位素的标签,通过特异性标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基团,而后进行串联质谱分析,可同时比较10组不同样品中蛋白质的相对含量。TMT技术是常用的差异蛋白质组学技术,在疾病标记物筛选、药物作用靶点、动植物抗病/抗胁迫机制、动植物发育分化机理等领域都有广泛应用。
lLabelfree蛋白质组学:蛋白质非标记定量技术(label-free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。Label-free的技术优势就在于蛋白质不需要昂贵的同位素标签进行标记,所需样品总量少,耗费低。Label-free技术可用于高通量的biaomarker筛选、蛋白质相互作用、蛋白质翻译后修饰等方面的定量比较分析。
lDIA蛋白质组学:数据非依赖性的扫描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近几年来发展的一种新的质谱数据采集方式。可以对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子信息进行蛋白定性和定量。目前流行的蛋白质组学研究手段,如iTRAQTMT、 Label-free、SILAC采用的都是数据依赖性的扫描模式(Data-dependent acquisition, DDA)。DIA具有高通量、高分辨率、高可重现性、定量准确等优点,而且样本无需分级上机,极大的缩短了每个样品的检测时间,适合大样本量的蛋白质组研究。相对于DDA, DIA 具有更好的准确性和可重复性,是蛋白质组学研究的一大重要趋势。
l4D-DIA/labelfree:4D蛋白质组是新一代蛋白质组学分析技术, 由布鲁克公司与蛋白质组学领域的领军人物Matthias Mann, Ruedi Aebersold, Jürgen Cox , Ben Collins和Hannes Roest等科研团队合作推出的技术。4D-Proteomics™: 在传统保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity) 的基础之上增加了第四维的离子淌度(mobility)的分离。4D label free/DIA蛋白组鉴定能力提高50%以上,对比常规的 label free/DIA具有鉴定数更多、样本量需求更少、鉴定更精准的。
lAstral-DIA蛋白质组:Astral-DIA蛋白质组是基于Orbitrap Astral质谱仪检测的DIA蛋白质组学产品,Orbitrap Astral质谱仪在检测通量、蛋白组覆盖深度、灵敏度及精准定量等多个维度具有卓越性能,与DIA定量技术的完美结合,检测更稳定,大大推动蛋白质组学在肿瘤、疾病、生长发育、植物等领域的应用。
lOlink蛋白质组学:Olink采用具有独立知识产权的PEA(Proximity Extension Assay,邻位延伸分析技术),将带有特有核苷酸序列探针的一对抗体与被检测蛋白质特异性结合,正确且邻位探针通过末端5bp配对碱基互补结合,在延伸酶的作用下形成双链模板,利用qPCR或NGS进行检测,通过特异性的核苷酸序列信号来反应所检测蛋白质的含量。