单细胞测序技术是获得不同组织器官之间细胞的异质性信息，为生命科学领域的研究提供一个强有力的平台工具的技术手段。

单细胞测序技术的普遍原理

单细胞测序的技术原理因平台不同而千差万别，但其中最为关键的两个步骤即细胞捕获与分子定量，细胞捕获 (capture) 的技术决定了细胞的筛选方式以及实验的通量，目前最常用的方法有基于微孔microwell-，微流 microfluidic- 的捕获平台。

单细胞测序应用方向

单细胞测序应用方向广泛，可用于细胞图谱的绘制、生物标记物的搜寻、稀有细胞类型的鉴定、信号通路的分析、疾病肿瘤的研究 以及组织器官表型的丰富。

应用细胞图谱绘制

干细胞分化以及组织器官发育研究

全面剖析干细胞异质性，鉴定细胞不同表型，寻找不同类型干细胞的特异性标记，解析干细胞分化和组织器官发育的分子机理。

神经系统发育研究

研究神经细胞的异质性以及神经细胞的分群情况，有助于我们对神经系统的发育以及神经疾病的早期表现更加深入的理解。

免疫方向研究

分析并展示病原体导致的免疫细胞高度异质性，从而理解机体复杂的免疫机制；并且可以发现新的标记基因，结合特定膜蛋白抗体进行验证，便于更深层次地挖掘免疫反应的分子机理。

肿瘤异质性研究

研究肿瘤细胞异质性、肿瘤细胞分群以及新类型细胞的发现，寻找新的致病途径与分子机制。

疾病分型以及用药指导

结合传统病理学特征，发现异常状态下产生变化的细胞类型，辅助疾病分型；分别从转录组和蛋白组的水平，验证靶点药物的有效性，以及不同个体耐药性的差异，从而辅助相关药物的开发与应用。